W przypadku zdarzeń o podwyższonym ryzyku, jak np. wpływ niezidentyfikowanej przesyłki mogącej stanowić zagrożenie chemiczne, biologiczne lub radiacyjne - po dostarczeniu jej do BBK ABW realizowane są czynności i badania wynikające z algorytmu postępowania i współdziałania opracowanego przez Zespół Zadaniowy powołany decyzją nr 22 z dnia 7 marca 2014 r. przez Międzyresortowy Zespół do spraw Zagrożeń Terrorystycznych. Zgodnie z wypracowanym algorytmem BBK ABW zostało wskazane jako służba wykonawcza odpowiedzialna za badania identyfikacyjne w przypadku wykrycia w podejrzanej korespondencji materiału chemicznego. Postępowanie zakłada przejęcie od Państwowej Straży Pożarnej takiej właśnie przesyłki w przypadku ujawnienia jej w urzędach centralnych i obiektach służb specjalnych na terenie m. st. Warszawy.
W marcu 2015 r. uruchomiony został proces wdrażania rekomendacji ujętych w sprawozdaniu końcowym z prac Zespołu Zadaniowego do spraw opracowania algorytmu postępowania i współdziałania w przypadku otrzymania niezidentyfikowanej przesyłki mogącej stanowić zagrożenie chemiczne, biologiczne lub radiacyjne, działającego w ramach Międzyresortowego Zespołu ds. Zagrożeń Terrorystycznych. Zaangażowanie Agencji Bezpieczeństwa Wewnętrznego w realizację algorytmu pociągnęło za sobą opracowanie wewnętrznej procedury dotyczącej m.in. specjalistycznych badań i postępowania z niezidentyfikowaną przesyłką dostarczoną do urzędów administracji publicznej, zawierającą materiał chemiczny i skierowaną do badań w BBK ABW (zgodnie z kryteriami klasyfikacji przesyłki niebezpiecznej wskazanymi w przedmiotowym algorytmie postępowania). Osiągnięcie gotowości realizacyjnej w tym zakresie nastąpiło przed datą rozpoczęcia Szczytu NATO w Warszawie w 2016 r.